考生报考初级会计职称时发现毕业证书丢了，若考生拥有门认可的更高学历证明，可以通过出具更高的学历证明进行资料审核；若考生没有更高学历证明，可由原毕业学校或原毕业学校所在地的教育行政主管部门开具的学历证明或毕业证遗失证明，进行考试报考。

根据初级会计资格考试报名要求，考生必须具备门认可的高中毕业（含高中、中专、职高和技校）及以上学历，考生的学历证明是初级会计资格考试审核的必要资料。需注意的是，初级会计职称考试报名实行属地化管理原则，考生丢失毕业证时，应参考当地具体政策要求，进行学历证明的补办。